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甲型流感病毒基因變異與生存選擇壓力相關(guān)性分析 【?2006-01-05 發(fā)布?】 臨床報道
(上海)為了研究甲型流感病毒基因變異與生存選擇壓力的關(guān)系,指導(dǎo)保守疫苗靶位點的尋找,研究者選擇相同血凝素(HA)血清型具有全基因組序列的分化距離較近的多個流感病毒株系,利用Blast2程序計算各株系之間的核酸保守性、蛋白質(zhì)保守性、變異核苷酸在密碼子序位中的頻率以及生存選擇壓力指數(shù),分析與生存選擇壓力指數(shù)的相關(guān)性。結(jié)果HA基因較其他基因的核酸保守性為顯著低;HA抗原蛋白質(zhì)保守性與NS基因同為較低;HA基因受生存選擇壓力作用;NS、聚合酶B1(PB1)基因受選擇壓力較小;NA、核蛋白(NP)基因受選擇壓力較大,生存選擇壓力指數(shù)與核苷酸第3密碼子位點變異頻率完全相關(guān)。可見流感病毒基因變異受復(fù)制機制形成差異和生存選擇壓力淘汰差異雙重作用影響,各基因在流感病毒生物功能中地位不同,NA、NP基因保守性較強,適宜作為疫苗靶位點候選,HA基因相比較具有一定的保守性,有望尋找到保守區(qū)段,NS、PB1基因保守性較弱,不宜作為靶位點。 /**/
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