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cDNA微陣列對22例彌漫型胃癌基因的檢測

【?2006-10-16 發布?】 臨床報道  

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    (上海)為了從轉錄組水平識別彌漫型胃癌與正常胃黏膜間的基因表達差異,探討胃癌分子發生發展機制。研究者收集22例彌漫型胃癌患者的新鮮凍存胃癌組織及同例相應正常胃黏膜。雜交芯片采用含14 592個點的cDNA表達譜芯片。差異表達基因的篩選標準為該基因在50%以上樣本中的腫瘤與正常組織熒光強度比(ratio比值)>2或<0.5。采用系統聚類法進行基因表達的相似性分析,標本組間比較采用方差分析。應用實時定量RT-PCR方法對芯片結果進行驗證。結果胃癌組織與正常胃黏膜間的差異表達基因共357個,其中表達上調者153個,下調者204個。上調基因功能主要與細胞骨架運動、基質重建、細胞增殖及信號傳導等相關,下調基因功能則主要與細胞免疫防御、毒理代謝、功能分化、核-漿轉運及凋亡抑制等相關。TNM分期的Ⅰ+Ⅱ期組與Ⅲ+Ⅳ期組間,有7個基因的表達差異有統計學意義(P<0.05)。RT-PCR驗證結果與芯片表達結果一致。可見運用cDNA芯片進行彌漫型胃癌基因表達譜分析,有助于從分子水平全方位闡明彌漫型胃癌的發病機制及生物學特性,也有助于進一步發現新的分子診斷指標和基因治療靶標。 /**/
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