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美利用基因工程技術(shù)研制生物計(jì)算機(jī) 【?2008-06-03 發(fā)布?】 美迪醫(yī)訊
傳統(tǒng)的“翻煎餅難題”中包含了一堆不同大小的煎餅,每個(gè)煎餅都有金黃色面和烤焦面。要求是將最大的煎餅放在最底下并使得每個(gè)煎餅的金黃色面朝上,而解決者操作的每一步只能一次操作一個(gè)或者連續(xù)的幾個(gè)煎餅,改變其順序或者朝向以達(dá)到要求,步驟最少的路徑為最佳解。這一傳統(tǒng)問題是計(jì)算機(jī)領(lǐng)域的一個(gè)基本算法問題。 實(shí)驗(yàn)中,研究人員把DNA片段當(dāng)作“煎餅”,把從其他細(xì)菌中分離得到的基因添加到大腸桿菌中,并且設(shè)計(jì)了一個(gè)利用特異性位點(diǎn)進(jìn)行重組的系統(tǒng)來實(shí)現(xiàn)DNA元件的倒置,這樣大腸桿菌就可以通過DNA片段的移動(dòng)和反向插入來進(jìn)行“DNA煎餅”的排序和翻轉(zhuǎn)。同時(shí)研究人員也為大腸桿菌加入了一個(gè)可以使大腸桿菌獲得抗生素抗性的基因,只有當(dāng)DNA片段排序正確時(shí),大腸桿菌才顯出抗性。這個(gè)數(shù)學(xué)問題在細(xì)菌中被解決的時(shí)間反映了解決煎餅難題所需要的最少步驟。 研究小組帶頭人卡麥樂•海恩斯解釋說,與傳統(tǒng)計(jì)算機(jī)相比,這種生物計(jì)算機(jī)有更多潛在的優(yōu)勢,一個(gè)小搖瓶就可以培養(yǎng)上百億的細(xì)菌,每一個(gè)都能包含多個(gè)拷貝的DNA片段用來計(jì)算;而且這些細(xì)菌計(jì)算機(jī)能夠平行工作互不干擾,這就意味著它們有可能比傳統(tǒng)計(jì)算機(jī)更快,用更少的空間,使用更低的成本;除了平行外,生物計(jì)算機(jī)由于以活的生物為載體,也可以利用修復(fù)機(jī)制在重復(fù)使用后進(jìn)化。 隨著對(duì)生物的研究越來越細(xì)化,人們開始利用細(xì)胞來完成設(shè)計(jì)者設(shè)想的各種任務(wù),這一學(xué)科被稱為合成生物學(xué)。例如把網(wǎng)絡(luò)同簡單的細(xì)胞相結(jié)合,提高生物傳感性以幫助檢查人員確定地雷或生物武器的位置等工作。此項(xiàng)研究的順利完成,不僅證明了在生物細(xì)胞里進(jìn)行高強(qiáng)度的計(jì)算是可行的,而且為包括數(shù)據(jù)儲(chǔ)存以及基因操作在內(nèi)的應(yīng)用開辟了新途徑,是合成生物學(xué)領(lǐng)域的一個(gè)突破。 本文關(guān)鍵字:
生物 計(jì)算機(jī)
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