重慶市食品藥品監督管理局在學習實踐科學發展觀過程中，采取多項措施，重新全面清理藥品、醫療器械行政許可項目，堅持效能優先，服務全市醫藥產業健康發展。 
 
一是對照法律法規，逐項清理行政許可項目及其法律依據。經清理，主動取消有法律依據但屬重復審批的許可事項《國產二類醫療器械臨床試驗審批》，簡化了企業注冊二類醫療器械的審批手續；合并了由兩個處室分段辦理，重復受理的多個許可項目，一次受理，內部流轉，一次發證，方便了企業申辦；同時，學習好的經驗，對法定職權內的行政許可，全部予以立項，不以目前是否開展為準，以適應和促進全市醫藥經濟的發展。 
 
二是嚴格許可時限。對照法律法規，逐項審查許可時限，所有行政許可時限必須服從法律規定；有關補正資料、抽樣檢驗、現場考察、專家評審等專門時限，均在審批時限中予以明確，避免含混不清，拖延辦理；對實際工作中能夠縮減時限的項目，盡量縮短時限，并以承諾時限對外公告，目前，已有5個項目在法定時限的基礎上縮短辦理時限，其中《藥品生產質量管理規范認證證書》核發縮短時限最長，對社會承諾提前62個工作日辦結。 
 
三是細化審批須知。統一制定許可項目審批須知模本，各業務處室按照模本要求，全面修訂細化審批須知，在市局網站公示審批項目目錄、各許可項目名稱、法定實施主體、法律依據、收費標準、收費依據、辦理時限、受理范圍、許可程序、所需資料以及各辦理環節的具體時限、審查內容、審查標準、辦理崗位、辦理人員崗位職責，使申請人和公眾對行政許可的相關內容一目了然，增加了行政許可的透明度。 
 
四是擴大公示范圍，推行陽光行政。重慶市食品藥品監督管理局根據《行政許可法》關于行政許可公開、公平、公正的原則，對所有行政許可項目全部予與公示公告，主動接受社會各界的監督，并方便相關企事業單位查詢。 
 
五是嚴格對辦理部門的監督。由行政審批受理中心統一接件、受理、發證，行政許可程序、標準、時限重新確定以后，受理中心完善了對行政許可辦理過程的監督機制，統一管理行政許可檔案，實行了行政許可辦理時限警示制，行政許可辦理資料抽查制，對行政許可辦理各環節全面實施監控，每月在局長辦公會通報行政許可辦理事項及存在的問題，督促辦理部門依法辦理行政許可。