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生物樣本庫(kù)標(biāo)準(zhǔn)化建設(shè)深度剖析 【?2015-04-08 發(fā)布?】 美迪醫(yī)訊
第七屆中國(guó)生物樣本庫(kù)標(biāo)準(zhǔn)化建設(shè)與應(yīng)用研討會(huì)已順利閉幕,本屆會(huì)議以“生物樣本庫(kù):學(xué)科建設(shè)與醫(yī)院可持續(xù)發(fā)展的堅(jiān)強(qiáng)基石”為主題,來(lái)自國(guó)內(nèi)外的專家學(xué)者就我國(guó)生物樣本庫(kù)標(biāo)準(zhǔn)化建設(shè)問(wèn)題展開(kāi)深度交流,并分享了諸多成功案例。本屆大會(huì)看點(diǎn)頗多,生物樣本庫(kù)整體解決方案及標(biāo)準(zhǔn)化生物樣本庫(kù)建設(shè)流程成為一大亮點(diǎn)。 BIMS生物樣本庫(kù)整體解決方案主要流程為:樣本庫(kù)規(guī)劃建設(shè)→樣本采集→樣本處理→樣本信息獲取→樣本存儲(chǔ)→樣本信息管理。 l 場(chǎng)地規(guī)劃建設(shè) 在建筑行業(yè)有著“百年基業(yè)從地基開(kāi)始”的行業(yè)準(zhǔn)則,在生物樣本庫(kù)硬件建 設(shè)中堅(jiān)持這一標(biāo)準(zhǔn)也十分重要。從場(chǎng)地基礎(chǔ)建設(shè)與規(guī)劃角度出發(fā),如何搭建好硬件平臺(tái)成就百年生物樣本庫(kù)基業(yè),是生物樣本庫(kù)建設(shè)的第一個(gè)難題。一個(gè)完整的生物樣本庫(kù)應(yīng)該具備辦公區(qū)、實(shí)驗(yàn)區(qū)、保存區(qū)等職能劃分,常見(jiàn)的考核標(biāo)準(zhǔn)有:美觀大方、工作方便、便于升級(jí)、持久耐用、快速檢修和安全性好。來(lái)自上海交通大學(xué)附屬仁濟(jì)醫(yī)院康曉楠主任強(qiáng)調(diào)樣本庫(kù)建設(shè)必須遵從三大原則,即國(guó)際化的建庫(kù)原則,規(guī)范的倫理法則,嚴(yán)格的技術(shù)操作規(guī)范,并與大家一起分享了仁濟(jì)醫(yī)院生物樣本庫(kù)的硬軟件系統(tǒng),探討生物樣本信息的智能化管理。
上海交大仁濟(jì)醫(yī)院生物樣本庫(kù)規(guī)劃圖
l 樣本采集要有標(biāo)準(zhǔn) 樣本采集是生物樣本庫(kù)樣本操作的第一步,高質(zhì)量的生物樣本也是樣本檢測(cè)的基礎(chǔ)。建庫(kù)采樣過(guò)程中如何實(shí)現(xiàn)規(guī)范化與統(tǒng)一化,是很多醫(yī)院在建庫(kù)過(guò)程中所面對(duì)的第一大問(wèn)題。來(lái)自復(fù)旦大學(xué)附屬中山醫(yī)院樊嘉教授指出,只有通過(guò)建立統(tǒng)一的樣本采集標(biāo)準(zhǔn)并嚴(yán)格貫徹實(shí)施,才能夠有效保證樣本的統(tǒng)一與規(guī)范。會(huì)中,樊嘉教授還為大家展示了醫(yī)院建庫(kù)過(guò)程中組織樣本采集的標(biāo)準(zhǔn)操作規(guī)程,為建庫(kù)樣本采集、處理提供了參考樣板。
實(shí)際上,不同樣本的采集過(guò)程各有不同,但基本的流程是一致的:在開(kāi)展一個(gè)樣本采集計(jì)劃前,項(xiàng)目組必須向倫理委員會(huì)提交項(xiàng)目相關(guān)文件及樣本采集計(jì)劃并通過(guò)倫理審查。同時(shí),樣本采集還必須獲得捐贈(zèng)者的同意,并在符合法規(guī)的框架下簽訂知情同意書(shū)。當(dāng)?shù)玫骄栀?zèng)者的知情同意并采集到樣本后,生物樣本庫(kù)就擁有了對(duì)樣本的保管權(quán)。
l 樣本處理 對(duì)樣本的標(biāo)準(zhǔn)化處理是構(gòu)建樣本庫(kù)最重要也是最核心的一部分,高質(zhì)量的生物樣本不僅決定了后續(xù)樣本信息獲取的成敗,同時(shí)國(guó)家也對(duì)處理后的樣本有著明確的質(zhì)量規(guī)定。面對(duì)來(lái)之不易的原始樣本,不僅要求實(shí)驗(yàn)室操作人員具備良好的實(shí)驗(yàn)室技能,還需要優(yōu)質(zhì)的實(shí)驗(yàn)室基礎(chǔ)設(shè)備作為保障樣本質(zhì)量的硬件支撐。實(shí)驗(yàn)室設(shè)備的任何故障與缺陷都將對(duì)樣本處理帶來(lái)不可逆的負(fù)面影響。因此,選擇優(yōu)質(zhì)的設(shè)備合作伙伴對(duì)實(shí)驗(yàn)室及生物樣本庫(kù)而言不僅關(guān)鍵而且必要。目前實(shí)驗(yàn)室基礎(chǔ)儀器市場(chǎng)良莠不齊,面對(duì)繁雜的產(chǎn)品目錄與品牌,實(shí)驗(yàn)室如何用有限的經(jīng)費(fèi)購(gòu)買(mǎi)到質(zhì)優(yōu)的儀器一直是實(shí)驗(yàn)室采購(gòu)討論的熱點(diǎn)。 隨著國(guó)內(nèi)生物醫(yī)療的崛起,不少國(guó)內(nèi)優(yōu)質(zhì)品牌開(kāi)始涌現(xiàn),如海爾生物醫(yī)療就是其中的佼佼者。海爾生物醫(yī)療不僅能夠?yàn)閷?shí)驗(yàn)室提供質(zhì)優(yōu)價(jià)廉的基礎(chǔ)設(shè)備,如生物安全柜、超凈工作臺(tái)、恒溫培養(yǎng)箱等,而且借助海爾集團(tuán)的強(qiáng)大背景,在售后方面也有著良好表現(xiàn)。據(jù)悉,此次參會(huì)的醫(yī)院中,301醫(yī)院、上海交通大學(xué)附屬仁濟(jì)醫(yī)院、北京協(xié)和醫(yī)院等多家醫(yī)院都使用了海爾生物醫(yī)療的實(shí)驗(yàn)室設(shè)備構(gòu)建生物樣本庫(kù)。
l 樣本信息獲取 通過(guò)前面一系列處理后的原始樣本,下一步需要通過(guò)基因測(cè)序手段獲取其生物學(xué)信息,這些信息作為生物樣本庫(kù)大數(shù)據(jù)的基礎(chǔ)組成,在轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)應(yīng)用中發(fā)揮著重要作用。一個(gè)錯(cuò)誤的生物信息不但很有可能改變整個(gè)大數(shù)據(jù)診斷的方向,更有可能影響人們對(duì)疾病的認(rèn)知與判斷。因此,面對(duì)樣本信息必須秉持“零容忍”態(tài)度。目前,我國(guó)測(cè)序工作主要由“國(guó)家隊(duì)”與“企業(yè)隊(duì)”組成,其中深圳國(guó)家基因庫(kù),也是我國(guó)首個(gè)國(guó)家級(jí)基因庫(kù),在樣本測(cè)序及信息服務(wù)中代表著國(guó)內(nèi)最高水平。深圳國(guó)家基因庫(kù)不僅致力于生物樣本和基因數(shù)據(jù)的收集,保存及分類(lèi)管理,還通過(guò)與國(guó)內(nèi)企業(yè)海爾生物醫(yī)療的合作,共同促進(jìn)生物樣本庫(kù)的臨床應(yīng)用,推動(dòng)中國(guó)生命科學(xué)的發(fā)展。 l 樣本存儲(chǔ) 面對(duì)完成信息采集后的大量樣本,如何能既保持優(yōu)質(zhì)質(zhì)量又方便查找,一直是樣本存儲(chǔ)的老大難問(wèn)題。在本屆大會(huì)上,解放軍總醫(yī)院副院長(zhǎng)郭渝成從樣本存儲(chǔ)區(qū)建設(shè)的角度分享了解放軍總醫(yī)院的經(jīng)驗(yàn)。 根據(jù)一個(gè)項(xiàng)目采集的整體計(jì)劃來(lái)設(shè)計(jì)樣本的存儲(chǔ)方案,內(nèi)容包括存儲(chǔ)設(shè)備、容器、凍存架、凍存管及其容量等。一個(gè)好的存儲(chǔ)方案可有效地利用空間,節(jié)約經(jīng)費(fèi),更加規(guī)范的進(jìn)行管理,保證樣本的存儲(chǔ)安全。 樣本的存儲(chǔ)步驟一般分為: 1. 凍存管裝存。珍貴樣本存儲(chǔ)的第一步是用凍存管裝存,目前市場(chǎng)上凍存管種類(lèi)繁多,常見(jiàn)的考核角度主要圍繞凍存管的質(zhì)量,種類(lèi)、顏色等方向進(jìn)行。在品牌選擇上,除了海外進(jìn)口,近幾年在我國(guó)也涌現(xiàn)出一部分優(yōu)質(zhì)凍存管品牌,如海爾T系列凍存管,由醫(yī)用級(jí)材料制成,規(guī)格多樣,色標(biāo)九色可選,可承受超低溫保藏,滿足用戶多樣的存儲(chǔ)需求,較進(jìn)口品牌更為高性價(jià)比。值得一提的是其最新產(chǎn)品2D凍存管,擁有最強(qiáng)的識(shí)別信號(hào),激光蝕刻條形碼,外加凍存盒選型豐富,可覆蓋樣本庫(kù)各種常規(guī)凍存管的存放需求。凍存盒蓋上印有的網(wǎng)格和編碼,不僅便于庫(kù)存管理,還可確保樣本存儲(chǔ)更加序。
2. 超低溫保存。樣本裝存到凍存管與凍存盒后,需要置于超低溫條件下進(jìn) 行長(zhǎng)期保存,以降低樣本自身的生化反應(yīng),提高樣本中各種成分的穩(wěn)定性。目前主流的存儲(chǔ)形式有超低溫冰箱存儲(chǔ)與氣相液氮存儲(chǔ),實(shí)際建庫(kù)過(guò)程中,多數(shù)樣本庫(kù)首選還是超低溫冰箱。在超低溫冰箱衡量標(biāo)準(zhǔn)上,除了在存儲(chǔ)過(guò)程中能夠穩(wěn)定正常運(yùn)行外,冰箱的裝載量與節(jié)能性也是重要衡量指標(biāo)。 會(huì)中,郭渝成教授展示了301醫(yī)院生物樣本庫(kù)的樣本存儲(chǔ)區(qū)。海爾超級(jí)節(jié)能芯超低溫冰箱728J,不但節(jié)能省電,一個(gè)樣本庫(kù)10年節(jié)省200萬(wàn)元,同時(shí)50000份樣本的最大整機(jī)裝箱量也極大地提升了樣本庫(kù)空間的使用率。
l 樣本信息化管理 面對(duì)繁雜海量的生物信息大數(shù)據(jù),中國(guó)醫(yī)藥生物技術(shù)協(xié)會(huì)生物樣本庫(kù)分會(huì)主任委員郜恒駿教授指出:我國(guó)目前現(xiàn)有生物樣本庫(kù)建設(shè)缺乏統(tǒng)一的標(biāo)準(zhǔn),且樣本庫(kù)的信息化程度不高,國(guó)內(nèi)很多的樣本庫(kù)只有數(shù)量龐大的數(shù)據(jù),卻沒(méi)有相應(yīng)的技術(shù)把他們利用起來(lái)。
對(duì)此,上海交通大學(xué)附屬第六人民醫(yī)院王從容主任指出,加強(qiáng)樣本庫(kù)全面信息化管理十分必要,面對(duì)如此龐大且復(fù)雜的數(shù)據(jù)資源,必須搭配高效的信息管理系統(tǒng)。在大會(huì)中,王從容主任分別從冰箱出入庫(kù)管理系統(tǒng)、冷鏈溫度監(jiān)控系統(tǒng)和臨床資料系統(tǒng)管理這三個(gè)方面,與大家一起分享了第六人民醫(yī)院信息化建設(shè)經(jīng)驗(yàn)。
針對(duì)生物樣本信息智能化管理的難題,本次大會(huì)上,海爾發(fā)布NG BIMS靈瓏系統(tǒng),與參會(huì)者共同深入探討生物信息管理議題。據(jù)了解,新一代BIMS靈瓏系統(tǒng),融合三大優(yōu)勢(shì),即“平臺(tái)化-小樣本大數(shù)據(jù)”、“個(gè)性化-自由定制”、“圖形化-所見(jiàn)所得”,打造中國(guó)生物樣本庫(kù)自主創(chuàng)新的最佳方案。
“誰(shuí)擁有資源,誰(shuí)就擁有發(fā)展的主動(dòng)權(quán),誰(shuí)就擁有未來(lái)”。分子腫瘤學(xué)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室主任詹啟敏院士在此次大會(huì)中指出。
我國(guó)人口數(shù)量眾多,擁有豐富的各類(lèi)樣本資源。發(fā)揮這種資源的優(yōu)勢(shì),建立高平的生物樣本庫(kù)和共享機(jī)制,是我國(guó)在各項(xiàng)疾病研究和臨床治療中實(shí)現(xiàn)彎道超車(chē)并逐步引領(lǐng)的重要保障。海爾生物醫(yī)療作為低溫冷鏈及生物樣本庫(kù)領(lǐng)域的領(lǐng)先品牌,自成立之初一直致力為生物樣本庫(kù)的發(fā)展以及轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)提供強(qiáng)有力的支持和全方位的保障,以全新智能創(chuàng)新產(chǎn)品及解決方案,推動(dòng)和引領(lǐng)生物醫(yī)療行業(yè)發(fā)展,支持中國(guó)醫(yī)療及生命科學(xué)領(lǐng)域新發(fā)展。 本文關(guān)鍵字:
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