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2003年北京地區(qū)流行的麻疹野病毒株的基因型分析 【?2006-09-27 發(fā)布?】 臨床報道
(北京)為了了解北京地區(qū)2003年流行的麻疹病毒的優(yōu)勢基因型。研究者采集2003年北京地區(qū)暴發(fā)和散發(fā)麻疹臨床病例咽喉拭子,使用WHO推薦的Vero/SLAM細(xì)胞進(jìn)行麻疹病毒分離。用逆轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈反應(yīng)(RT-PCR)擴(kuò)增麻疹病毒分離株的核蛋白(N)基因碳末端450個核苷酸。對擴(kuò)增產(chǎn)物的核苷酸序列進(jìn)行測定和分析,并與麻疹病毒基因庫中參考株進(jìn)行比較,參考株包括H1a基因型9株,H1h基因型2株,H1c基因型7株,H2基因型1株,A基因型3株。結(jié)果從北京的7個行政區(qū)縣的麻疹患者的咽喉拭子中共分離到8株麻疹病毒,經(jīng)對分離株的核蛋白(N)碳末端450個核苷酸進(jìn)行序列測定和分析,并與國內(nèi)基因庫中的22個參考株進(jìn)行基因親緣性關(guān)系比較,該8株麻疹病毒均為H1a基因型。該8株病毒與H1a參考株Chin9322、H1b參考株Chin9475和H1c參考株Chin9427的平均遺傳距離分別為0.004~0.011,0.026~0.031和0.015~0.022;而與H1a參考株中的Anhui01-1,Anhui02-2的平均遺傳距離最近,為0.000~0.009??梢?003年北京地區(qū)流行的麻疹病毒的優(yōu)勢基因型為H1a基因型,與北京往年的本土流行株存在明顯核苷酸差異,H基因型的H1b、H1c以及H2基因型在北京地區(qū)可能已經(jīng)消失。
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